Перестал срабатывать RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} в .htaccess на одном проекте. И на этом же сервере, у другого проекта – работало.
Вот такое перенаправление:
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteRule ^ server.php [L]